Naruto Shippuuden je nastavak prve regularne sezone Naruto- a, te se odvija nakon dvije i pol godine
stanke.
Naruto se vraca u Konohagakure selo te ondje susrece neke stare i upoznaje nove prijatelje te se
suocava s novim protivnicima. Njegova je prva misija spasiti Gaara- u, Kazekage- a Sunagakure.
Pritom se upušta u borbu s Akatsuki- ima, kriminalnom organizacijom koja je za sada jedan od glavnih nositelja radnje.